Ce kit permet la détection qualitative in vitro des gènes ORF1ab/N/S du nouveau coronavirus 2019-nCoV dans des échantillons respiratoires, notamment des écouvillons oropharyngés, des écouvillons nasopharyngés et des expectorations, ainsi que le typage des mutations sur les délétions HV69-70. Comme indiqué dans la base de données GISAID, plus de 95 % des séquences variantes d'Omicron signalées incluent une délétion dans le gène HV69-70, ce qui peut entraîner une défaillance de la cible du gène S (SGTF) lors des tests PCR. Le SGTF peut être utilisé comme marqueur proxy pour le dépistage d'Omicron.
Les ensembles d'amorces et la sonde marquée FAM sont conçus pour la détection spécifique du gène ORF de laboratoire du 2019-nCoV, de la sonde marquée VIC pour le gène N du 2019-nCoV et de la sonde marquée ROX pour la mutation HV69-70 du gène S du 2019-nCoV. Le gène de la RNase P humaine extrait simultanément avec l'échantillon test fournit un contrôle interne pour valider la procédure d'extraction nucléique et l'intégrité du réactif. La sonde ciblant le gène de la RNase P humaine est marquée au CY5.
Système de PCR en temps réel : Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex. Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0. Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000 ;